非梗阻性无精子症的病因主要如下：
1、遗传学异常：染色体数目异常，如Klinefelter综合征，又称克氏综合征，染色体核型为47，XXY，是一种染色体数目异常所致的疾病，为临床上最常见的男性性腺功能低下，染色体结构异常，Y染色体微缺失，雄激素受体异常等。内分泌异常，如卡尔曼综合征、选择性促卵泡生长激素缺陷症。
2、感染性疾病：如流行性腮腺炎病毒引起的睾丸炎及性传播疾病所致的睾丸损伤等。
3、物理、化学及药物的影响：射线辐射及热辐射损伤、细胞毒性抗肿瘤药物、慢性酒精中毒等。
4、外伤及医源性损伤。
5、精索静脉曲张。
6、环境因素：如环境污染物、食品添加剂、有机溶剂、农药及除草剂等。
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